Khenpo Wangdu est né à Dhenko au Tibet le 20 février 1985. A l'âge de 6 ans, il entre au monastère et y étudie pendant 9 ans. Puis, afin de poursuivre ses études, il rejoint l'université bouddhiste Dzongsar Shédra dans l'Himachal Pradesh, où il étudie pendant 12 ans. Il décide ensuite de se spécialiser en littérature et histoire, pendant trois ans, à l'université d'études supérieures de Sara près de Dhéradun. En 2015, sur demande du 14ème Kunzig Shamar Rinpoché, il intègre en tant que professeur l'académie bouddhique Diwakar, à Kalimpong, où il enseigne divers sujets tels que la philosophie, la grammaire, l'histoire, la poésie, etc.
En 2018, il est nommé principal de l'académie bouddhique Diwakar et de l'école élémentaire Diwakar, à Takdah. Il est également très impliqué dans la nouvelle école de Karmapa (Karmapa Center of Education, à Kalimpong) où il est professeur principal et responsable du pôle tibétain.